取得できる値は「正確にはウインドウのサイズではなく、フレームのサイズ」になります。
ブラウザによって参照する場所が異なるので処理を分岐させて取得する必要があります。
InternetExplorer4, 5, 6:
document.body.clientWidth, document.body.clientHeight
NetscapeNavigator4, Netscape6/Mozilla, Opera6:
document.innerWidth, document.innerHeight